Yon nouvo zam pou dyagnostik tibèkiloz ak deteksyon rezistans dwòg: yon nouvo jenerasyon sekans vize (tNGS) konbine avèk aprantisaj machin pou dyagnostik ipèsansibilite tibèkiloz.
Rapò literati: CCa: yon modèl dyagnostik ki baze sou tNGS ak aprantisaj machin, ki apwopriye pou moun ki gen mwens tibèkiloz bakteri ak menenjit tibèkiloz.
Tit tèz: Sekans pwochen jenerasyon ki vize pou tibèkiloz ak aprantisaj machin: yon estrateji dyagnostik ultra-sansib pou tubulèr poumon pazif ak menenjit tubulaire.
Peryodik: 《Clinica Chimica Acta》
SI: 6.5
Dat piblikasyon: Janvye 2024
Konbine avèk University of Chinese Academy of Sciences ak Beijing Chest Hospital of Capital Medical University, Macro & Micro-Test te etabli yon modèl dyagnostik tibèkiloz ki baze sou nouvo jenerasyon teknoloji sekans vize (tNGS) ak metòd aprantisaj machin, ki te bay ultra-segondè. deteksyon sansiblite pou tibèkiloz ak kèk bakteri ak menenjit tibèkiloz, bay yon nouvo metòd dyagnostik ipèsansibilite pou dyagnostik klinik de kalite tibèkiloz, epi li te ede dyagnostik egzat, deteksyon rezistans dwòg ak tretman tibèkiloz.An menm tan an, yo jwenn ke plasma cfDNA pasyan an ka itilize kòm yon kalite echantiyon apwopriye pou echantiyon klinik nan dyagnostik TBM.
Nan etid sa a, yo te itilize 227 echantiyon plasma ak echantiyon likid serebrospinal pou etabli de kowòt klinik, kote yo te itilize echantiyon kowòt dyagnostik laboratwa yo pou etabli modèl aprantisaj machin nan dyagnostik tibèkiloz, epi yo te itilize echantiyon kowòt dyagnostik klinik yo pou verifye etablisman an. modèl dyagnostik.Tout echantiyon yo te premye vize pa yon pisin ki fèt espesyalman pou pran ankèt pou Mycobacterium tibèkiloz.Lè sa a, ki baze sou done sekans TB-tNGS, modèl pye bwa desizyon an itilize pou fè 5 fwa kwa-validasyon sou fòmasyon ak validation seri keu dyagnostik laboratwa a, epi yo jwenn papòt dyagnostik echantiyon plasma ak echantiyon likid cerebrospinal.Papòt la jwenn yo pote nan de seri tès nan keu dyagnostik klinik pou deteksyon, epi pèfòmans dyagnostik elèv la evalye pa koub ROC.Finalman, yo te jwenn modèl dyagnostik tibèkiloz la.
Fig. 1 dyagram chema nan konsepsyon rechèch
Rezilta yo: Dapre papòt espesifik echantiyon ADN CSF (AUC = 0.974) ak echantiyon cfDNA plasma (AUC = 0.908) detèmine nan etid sa a, nan mitan 227 echantiyon, sansiblite nan echantiyon CSF te 97.01%, espesifik la te 95.65%, ak sansiblite ak espesifik echantiyon plasma yo te 82,61% ak 86,36%.Nan analiz de 44 echantiyon pè nan plasma cfDNA ak ADN likid serebrospinal ki soti nan pasyan TBM, estrateji dyagnostik etid sa a gen yon konsistans segondè nan 90.91% (40/44) nan plasma cfDNA ak ADN likid cerebrospinal, ak sansiblite a se 95.45% (42/44).Nan timoun ki gen tibèkiloz poumon, estrateji dyagnostik etid sa a pi sansib a echantiyon plasma pase rezilta deteksyon Xpert nan echantiyon ji gastric ki soti nan menm pasyan yo (28.57% VS 15.38%).
Fig. 2 Pèfòmans analiz modèl dyagnostik tibèkiloz pou echantiyon popilasyon an
Fig. 3 Rezilta dyagnostik echantiyon pè yo
Konklizyon: Yo te etabli yon metòd dyagnostik hypersensitive pou tibèkiloz nan etid sa a, ki ka bay yon zouti dyagnostik ak pi gwo sansiblite deteksyon pou pasyan klinik ki gen tibèkiloz oligobacillary (kilti negatif).Deteksyon tibèkiloz ipèsansib ki baze sou cfDNA plasma ka yon kalite echantiyon apwopriye pou dyagnostik tibèkiloz aktif ak menenjit tibèkiloz (echantiyon plasma yo pi fasil pou kolekte pase likid serebrospinal pou pasyan yo sispèk nan tibèkiloz nan sèvo).
Lyen orijinal: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?via%3Dihub
Brèf entwodiksyon Macro & Micro-Test tibèkiloz seri pwodwi deteksyon
Nan sans de sitiyasyon an echantiyon konplike nan pasyan tibèkiloz ak bezwen divès kalite, Macro & Micro-Test bay yon seri konplè nan solisyon NGS pou fè ekstraksyon liquéfaction soti nan echantiyon krache, konstriksyon bibliyotèk Qualcomm ak sekans, ak analiz done.Pwodwi yo kouvri dyagnostik rapid nan pasyan tibèkiloz, deteksyon rezistans dwòg nan tibèkiloz, sezisman nan tibèkiloz mycobacterium ak NTM, dyagnostik ipèrsansibilite nan bakteri-negatif tibèkiloz ak moun tibèkiloz, elatriye.
Twous deteksyon seri pou tibèkiloz ak mikobakteri:
| Atik No | non pwodwi | kontni tès pwodwi yo | kalite echantiyon | modèl aplikab |
| HWTS-3012 | Egzanp lage ajan | Itilize nan tretman likidasyon echantiyon krache, li te jwenn yon nimewo dosye premye klas, Sutong Machinery Equipment 20230047. | krache | |
| HWTS-NGS-P00021 | Twous deteksyon Qualcomm kantite pou tibèkiloz ipèsansib (metòd kaptire sond) | Deteksyon ipèsansibilite ki pa pwogrese (byopsi likid) pou tibèkiloz poumon bakteri negatif ak nodil nan sèvo;Echantiyon moun yo sispèk yo enfekte ak tibèkiloz oswa mikobakteri ki pa tibèkiloz yo te analize pa gwo pwofondè sekans metagenomics, ak enfòmasyon deteksyon si wi ou non tibèkiloz oswa ki pa tibèkiloz mikobakteri yo te enfekte ak enfòmasyon prensipal premye liy rezistans dwòg nan mycobacterium tibèkiloz. yo te bay. | San periferik, likid lavaj alveola, hydrothorax ak ascites, echantiyon ponksyon konsantre, likid serebrospinal. | Dezyèm jenerasyon |
| HWTS-NGS-T001 | Mycobacterium sezisman ak twous deteksyon rezistans dwòg (metòd sekans anplifikasyon miltiplex) | Tès sezisman Mycobacterium, ki gen ladan MTBC ak 187 NTM;Deteksyon rezistans dwòg nan Mycobacterium tibèkiloz kouvri 13 dwòg ak 16 sit mitasyon debaz nan jèn rezistans dwòg. | Krache, likid lavaj alveola, hydrothorax ak ascit, echantiyon ponksyon konsantre, likid serebrospinal. | Dezyèm / twazyèm jenerasyon platfòm doub |
Pwen esansyèl: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium sezisman ak twous deteksyon rezistans dwòg (metòd anplifikasyon miltip)
Entwodiksyon pwodwi
Pwodwi a baze sou medikaman prensipal premye ak dezyèm liy ki dekri nan direktiv tretman TB OMS yo, makrolid ak aminoglikozid ki souvan itilize nan direktiv tretman NTM yo, ak sit rezistans dwòg yo kouvri tout yon gwoup sit ki gen rapò ak rezistans dwòg nan la. OMS Mycobacterium tibèkiloz konplèks mitasyon katalòg, osi byen ke lòt rapòte jèn rezistans dwòg ak sit mitasyon dapre ankèt la ak estatistik nan literati ki fè nòt segondè nan kay ak aletranje.
Sezisman idantifikasyon baze sou tansyon NTM yo rezime nan direktiv NTM pibliye pa Chinese Journal of Tibèkiloz ak Maladi Respiratwa ak konsansis ekspè yo.Jadendanfan sezisman ki fèt yo ka anplifye, sekans ak anote plis pase 190 espès NTM.
Atravè teknoloji anplifikasyon PCR multiplex ki vize, jèn jenotip ak jèn Mycobacterium ki reziste dwòg yo te anplifye pa PCR multiplex, epi yo te jwenn konbinezon anplikon jèn sib pou detekte.Pwodwi yo anplifye yo ka konstwi nan dezyèm jenerasyon oswa twazyèm jenerasyon bibliyotèk sekans segondè-debi, ak tout platfòm sekans dezyèm jenerasyon ak twazyèm jenerasyon ka sibi sekans gwo pwofondè pou jwenn enfòmasyon sekans jèn sib yo.Lè w konpare ak mitasyon li te ye nan baz done referans entegre (ki gen ladan katalòg mitasyon konplèks OMS Mycobacterium tibèkiloz ak relasyon li ak rezistans dwòg), yo te detèmine mitasyon ki gen rapò ak rezistans dwòg oswa sansiblite nan dwòg anti-tibèkiloz.Konbine ak solisyon tretman echantiyon krache pwòp tèt ou louvri nan Macro & mikwo-tès, pwoblèm nan nan efikasite anplifikasyon asid nikleyè ki ba nan echantiyon krache nan klinik (dis fwa pi wo pase sa yo ki nan metòd tradisyonèl yo) te rezoud, se konsa ke deteksyon sekans rezistans dwòg ka ka. dirèkteman aplike nan echantiyon krache klinik.
Ranje deteksyon pwodwi
34jèn ki gen rapò ak rezistans dwòg nan18dwòg anti-tibèkiloz ak6NTM dwòg yo te detekte, kouvri297sit rezistans dwòg;Dis kalite Mycobacterium tibèkiloz ak plis pase190kalite NTM yo te detekte.
Tablo 1: Enfòmasyon sou 18+6 Dwòg +190+NTM
Avantaj pwodwi
Bonjan adaptabilite klinik: echantiyon krache yo ka dirèkteman detekte ak ajan pwòp tèt li liquéfaction san kilti.
Operasyon eksperimantal la senp: premye tou anplifikasyon operasyon an senp, epi konstriksyon bibliyotèk la fini nan 3 èdtan, sa ki amelyore efikasite travay la.
Sezisman konplè ak rezistans dwòg: kouvri sit sezisman ak rezistans dwòg MTB ak NTM, ki se pwen kle nan enkyetid klinik, sezisman egzat ak deteksyon rezistans dwòg, sipòte lojisyèl analiz endepandan, ak jenere rapò analiz ak yon sèl klike sou.
Konpatibilite: konpatibilite pwodwi, adapte ak platfòm endikap ILM ak MGI/ONT.
Spesifikasyon pwodwi
| Kòd pwodwi | non pwodwi | Platfòm deteksyon | spesifikasyon |
| HWTS-NGS-T001 | Sezisman Mycobacterium ak twous deteksyon rezistans dwòg (metòd anplifikasyon miltip) | ONT、Illumina、MGI、Salus pro | 16/96rxn |
Tan poste: Jan-23-2024